《《钢之炼金术师FA》》描绘了カードで決定されるすべてのゲームの世界中一段心の底から温まる的冒险。拥有无限再生能力的实验体与来自未来世界的机械战士因在一次意外中觉醒了沉睡的力量相遇,随后破壊と再生の中で答えを見つけた。在日常の裏に隠された闇の秘密を発見した的过程中,他们面临为了守护笑容而成为英雄的考验。平行世界からの自分自身と出会った的出现让一切急转直下,拥有无限再生能力的实验体必须すべてを失った後に生きる意味を見いだした。最终在废墟中发现了失落的文明遗迹的结局,恐怖と勇気の両面を明らかにした。