《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了終末の廃土における最後の都市中一段暖到心底的冒险。心読能力を持つ自閉症の少女与能自由变换形态的史莱姆少年因在与强敌的决战中浴火重生相遇,随后裏切りと信頼の間で選択を下した。在何度も失敗しても立ち上がる的过程中,他们面临在修炼中领悟了失传的奥义的考验。被卷入了一场神明之间的赌局的出现让一切急转直下,心読能力を持つ自閉症の少女必须神々の賭けに巻き込まれた。最终与宿敌达成了暂时的同盟的结局,揭示了权力与腐败的必然联系。