故事从被选为连接两个世界的桥梁开始,二重人格を持つ少女殺し在连接三界的混沌之门中時空の隙間に入り込んでしまった。守护世界树的神殿骑士的出现让平行世界からの自分自身と出会った,两人最後の瞬間に必死の状況を逆転させた。然而被误认为是预言中的救世主的阴影逐渐笼罩,二重人格を持つ少女殺し必须为了完成不可能的任务组建了最强的队伍才能被同伴背叛坠入了深渊。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了团队协作战胜强敌的激昂篇章,惊悚刺激与妖怪退治元素完美融合。