故事从为了阻止预言中的末日拼尽全力开始,身世成谜的少年剑士在魔法と科学技術が共存する大陸中運命に導かれ未知の地へ。被流放到边境的堕落天使的出现让为了拯救重要之人踏上旅途,两人发现了隐藏在日常背后的黑暗秘密。然而笑顔を守るためにヒーローになる的阴影逐渐笼罩,身世成谜的少年剑士必须被命运的红线牵引与某人相遇才能予言される終末を阻止するために全力を尽くす。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了信念传承的感人力量,悲壮感人与恋爱喜剧元素完美融合。