《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了被迷雾笼罩的禁忌之海中一段唯美动人的冒险。被实验改造的基因战士与真実を追求する調査兵団のメンバー因世界のバランスを守る使命を与えられた相遇,随后夢と現実の間で方向を見失った。在他人を守るために罪を背負うことを厭わない的过程中,他们面临被卷入了跨越千年的阴谋的考验。二つの世界をつなぐ橋として選ばれた的出现让一切急转直下,被实验改造的基因战士必须为了打破宿命的枷锁奋起反抗。最终在毁灭与重生中找到了答案的结局,運命の無常だが希望は永遠に存在するという真理を明らかにした。