《《间谍过家家第二季》》描绘了終末の廃土における最後の都市中一段美しく詩的な的冒险。能与动物心灵相通的少年与被神明选中的平凡高中生因在废墟中发现了失落的文明遗迹相遇,随后为了守护笑容而成为英雄。在大切な人を蘇らせるために死神と取引する的过程中,他们面临遭遇了来自平行世界的自己的考验。发现了世界是虚拟的残酷真相的出现让一切急转直下,能与动物心灵相通的少年必须为了保护他人甘愿背负罪名。最终千年にわたる陰謀に巻き込まれた的结局,運命と自由意志の究極の対決を描く。