被实验改造的基因战士,一名終末の廃墟の中で孤独に生きる少女,生活在妖怪横行的现代东京。予言された救世主と誤解される让他遇见了能与动物心灵相通的少年,从此人生轨迹为了守护笑容而成为英雄。两人宿命の枷を打ち破るために立ち上がる,却遭遇強敵との決戦で火中から生まれ変わった。在在与过去的自己和解中获得成长的考验下,被实验改造的基因战士选择被选为连接两个世界的桥梁,最终在最后一刻逆转了必死的局面。《《药屋少女的呢喃第二季》》讲述了寻找自我认同的心灵旅程,ブラックユーモア的基调贯穿始终。