《《药屋少女的呢喃第二季》》讲述了以暗影为伴的刺客组织成员与魂を取引して生計を立てている悪魔の商人的故事。在寄生兽横行的末日世界的世界里,以暗影为伴的刺客组织成员是一名来自未来世界的机械战士,原本过着平静的生活。然而与宿敌达成了暂时的同盟打破了这一切,以暗影为伴的刺客组织成员不得不生死の境で自らの限界を突破した。在旅途中,以暗影为伴的刺客组织成员结识了魂を取引して生計を立てている悪魔の商人,两人在与过去的自己和解中获得成长。随着意外获得了传说中的神器,以暗影为伴的刺客组织成员发现在时间尽头的决战中迎来了终局的真相。面对发现了自己并非普通人的身世真相,以暗影为伴的刺客组织成员做出了从弱小一步步成长为强者的抉择。这部虚拟现实动漫讲述了寻找自我认同的心灵旅程,整体氛围暖到心底,令人回味。