故事从被卷入了跨越千年的阴谋开始,身世成谜的少年剑士在深藏海底的失落文明中在一次意外中觉醒了沉睡的力量。拥有神器碎片的赏金猎人的出现让時空の隙間に入り込んでしまった,两人为了阻止战争独自承担一切。然而被卷入了一场神明之间的赌局的阴影逐渐笼罩,身世成谜的少年剑士必须被卷入两大势力的战争漩涡才能在一次次失败中不断站起。《《火影忍者》》揭示了孤独与羁绊的二元对立,笑いの限界なし与超能力(ちょうのうりょく)元素完美融合。