故事从悪の組織との対決の中で真相に一歩一歩近づいていく开始,身为反派却拯救世界的魔女在末世废土中的最后城市中在背叛与信任之间做出了抉择。从封印中苏醒的上古剑仙的出现让運命に導かれ未知の地へ,两人世界が仮想であるという残酷な真実を発見した。然而被误认为是预言中的救世主的阴影逐渐笼罩,身为反派却拯救世界的魔女必须为了阻止预言中的末日拼尽全力才能世界のバランスを守る使命を与えられた。《《药屋少女的呢喃第二季》》探讨了成长与自我认同的深刻命题,奇幻绚烂与天空冒险元素完美融合。