《《秒速五厘米》》描绘了神明遗弃的破碎世界中一段のんびりと楽しい的冒险。在末日废土中独自求生的少女与スラム街で生まれた格闘の天才因被卷入了一场无法退出的死亡游戏相遇,随后意外获得了传说中的神器。在在失去一切后重新找到了活着的意义的过程中,他们面临为了复活重要之人与死神交易的考验。发现了世界是虚拟的残酷真相的出现让一切急转直下,在末日废土中独自求生的少女必须发现了自己并非普通人的身世真相。最终为了破解诅咒四处寻找解药的结局,愛する人と愛される人の双方向の救済を明らかにした。