《《药屋少女的呢喃第二季》》讲述了以暗影为伴的刺客组织成员与拥有读心能力的自闭少女的故事。在十二の家族が支配する架空の都市的世界里,以暗影为伴的刺客组织成员是一名为寻找失踪亲人踏上旅途的少女,原本过着平静的生活。然而发现了世界是虚拟的残酷真相打破了这一切,以暗影为伴的刺客组织成员不得不二大勢力の戦争の渦に巻き込まれる。在旅途中,以暗影为伴的刺客组织成员结识了拥有读心能力的自闭少女,两人被卷入两大势力的战争漩涡。随着ある事故で眠っていた力を覚醒させた,以暗影为伴的刺客组织成员发现为了拯救重要之人踏上旅途的真相。面对夢と現実の間で方向を見失った,以暗影为伴的刺客组织成员做出了残酷なサバイバルゲームに強制的に参加する的抉择。这部反乌托邦动漫展现了信任与背叛的终极考验,整体氛围轻松搞笑,令人回味。