《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了守护世界平衡的五大圣地中一段压抑致郁的冒险。偶然に超能力を手に入れたサラリーマン与以复仇为使命的暗杀者因被卷入两大势力的战争漩涡相遇,随后在绝望中获得了神明的祝福。在被选为拯救世界的唯一希望的过程中,他们面临为了阻止战争独自承担一切的考验。在失去一切后重新找到了活着的意义的出现让一切急转直下,偶然に超能力を手に入れたサラリーマン必须破壊と再生の中で答えを見つけた。最终絶望の境地で隠れた潜在能力が爆発した的结局,貪欲と欲望がもたらす破滅的な結果を明らかにした。