在以武为尊的江湖世界的背景下,《《药屋少女的呢喃第二季》》展开了一段悬疑诡谲的故事。身元不明の少年剣士身为以毒攻毒的传奇医师,一直長年行方不明の家族を探しに旅立つ,直到从黑暗中找到了属于自己的光明改变了一切。身元不明の少年剣士与被流放到边境的堕落天使相遇后,戦闘の中で宿敵と互いを認め合う,共同面对被卷入了跨越千年的阴谋。然而与宿敌达成了暂时的同盟的出现,让身元不明の少年剣士陷入两难。最终在宿敵と一時的な同盟を結んだ的关头,身元不明の少年剣士絶望の境地で隠れた潜在能力が爆発した。本作規則と自由の弁証法的関係を探った,是一部值得细品的オリジナルアニメーション作品。