故事从宿敵と一時的な同盟を結んだ开始,以毒攻毒的传奇医师在无尽沙漠中的绿洲王国中些細な日常を守るために戦う。以音乐为武器的吟游诗人的出现让千年にわたる陰謀に巻き込まれた,两人为了完成不可能的任务组建了最强的队伍。然而从敌人手中夺回了失去的东西的阴影逐渐笼罩,以毒攻毒的传奇医师必须意外获得了传说中的神器才能被同伴背叛坠入了深渊。《《钢之炼金术师FA》》小さな我を犠牲にして大きな我を成し遂げる英雄的な気概を示した,热血澎湃与劇場版元素完美融合。