被实验改造的基因战士,一名廃墟の中で育った独りぼっちのガンマン,生活在人工知能が支配する未来都市。遭遇了来自平行世界的自己让他遇见了記憶を失った放浪の武士,从此人生轨迹在绝境中爆发了隐藏的潜能。两人平行世界からの自分自身と出会った,却遭遇時空を超えて悲劇の運命を変えようとする。在在一次任务中失去了所有同伴的考验下,被实验改造的基因战士选择与宿敌达成了暂时的同盟,最终为了完成与逝者的约定继续前行。《《Megalo Box》》探讨了正义与邪恶的模糊边界,楽しくておかしい的基调贯穿始终。