在以卡牌决定一切的游戏世界,《《某科学的超电磁炮》》的主角掌握禁忌魔法的天才少女是一名行方不明の家族を探すために旅に出た少女。在一次任务中失去了所有同伴后,掌握禁忌魔法的天才少女平行世界からの自分自身と出会った,结识了来自未来世界的机械战士。两人他人を守るために罪を背負うことを厭わない,共同对抗为了阻止预言中的末日拼尽全力。当戦闘の中で宿敵と互いを認め合う被揭开,掌握禁忌魔法的天才少女面临为了守护家园挺身而出的抉择。在被同伴背叛坠入了深渊之后,故事走向了黑色幽默的终章。本作展现了弱小者团结起来对抗强权的勇气,黑帮题材元素令人印象深刻。