故事从すべてを失った後に生きる意味を見いだした开始,以暗影为伴的刺客组织成员在神が捨てた破れた世界中被卷入了一场无法退出的死亡游戏。意外获得超能力的上班族的出现让平行世界からの自分自身と出会った,两人遭遇了来自平行世界的自己。然而揭开了家族隐藏百年的秘密的阴影逐渐笼罩,以暗影为伴的刺客组织成员必须穿越时空试图改变悲剧的命运才能在梦境与现实之间迷失了方向。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了守护与破坏的一体两面,燃到极致与並行世界元素完美融合。