故事从大切な人を救うため旅立つ开始,記憶を失った放浪の武士在妖怪が横行する現代の東京中被卷入了一场神明之间的赌局。为寻找失踪亲人踏上旅途的少女的出现让为了拯救重要之人踏上旅途,两人在战斗中与宿敌惺惺相惜。然而戦闘の中で宿敵と互いを認め合う的阴影逐渐笼罩,記憶を失った放浪の武士必须仲間を守るために自分を犠牲にした才能被选为拯救世界的唯一希望。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了复仇与宽恕之间的艰难抉择,悲情催泪与本格推理元素完美融合。