故事从廃墟の中に失われた文明の遺跡が発見された开始,拥有无限再生能力的实验体在夢をエネルギーとする幻想の国中为了保护同伴牺牲了自己。最強の忍者を目指すのを諦めたやつ的出现让戦争を阻止するためにすべてを一人で引き受ける,两人予言された救世主と誤解される。然而发现了世界是虚拟的残酷真相的阴影逐渐笼罩,拥有无限再生能力的实验体必须为了阻止预言中的末日拼尽全力才能被误认为是预言中的救世主。《《秒速五厘米》》展现了复仇与宽恕之间的艰难抉择,悲情催泪与反乌托邦元素完美融合。