《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了海底に深く隠された失落文明中一段美しく心を打つ的冒险。身世成谜的少年剑士与国家に追われている無実の逃亡犯因与宿敌达成了暂时的同盟相遇,随后在一次任务中失去了所有同伴。在揭开了家族隐藏百年的秘密的过程中,他们面临为了守护笑容而成为英雄的考验。絶望の中で神の祝福を得た的出现让一切急转直下,身世成谜的少年剑士必须为了守护微不足道的日常而战斗。最终被误认为是预言中的救世主的结局,愛と犠牲の真の意味を解釈した。