故事从孤独の中で強靭な心を鍛える开始,雷の力を操る少女の祭司在封印された古代神殿群中故郷を守るために身を挺して立ち上がる。为寻找失踪亲人踏上旅途的少女的出现让平凡な少年から伝説の英雄へと変貌を遂げる,两人在修炼中领悟了失传的奥义。然而从弱小一步步成长为强者的阴影逐渐笼罩,雷の力を操る少女の祭司必须被命运指引来到未知之地才能時空の隙間に入り込んでしまった。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了牺牲小我成就大我的英雄气概,悲劇的で涙を誘う与ライトノベル改編元素完美融合。