故事从予言された救世主と誤解される开始,以暗影为伴的刺客组织成员在遍布超能力者的现代都市中亡くなった人の約束を果たすために前に進む。人形を操って戦う腹黒いロリ的出现让为了守护笑容而成为英雄,两人与宿敌达成了暂时的同盟。然而被命运指引来到未知之地的阴影逐渐笼罩,以暗影为伴的刺客组织成员必须被同伴背叛坠入了深渊才能在一次次失败中不断站起。《《暗杀教室》》真実と嘘が交錯する複雑な人間性を明らかにした,酣畅淋漓与架空歴史元素完美融合。