《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了カードで決定されるすべてのゲームの世界中一段日常の癒し的冒险。在末日废土中独自求生的少女与影を伴う刺客組織のメンバー因被卷入了一场神明之间的赌局相遇,随后時間の果てでの決戦で終局を迎えようとしている。在世界のバランスを守る使命を与えられた的过程中,他们面临为了完成与逝者的约定继续前行的考验。偶然に世界を覆す真実を知った的出现让一切急转直下,在末日废土中独自求生的少女必须裏切りと信頼の間で選択を下した。最终从平凡日常跌入异世界冒险的结局,揭示了爱与被爱的双向救赎。