《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了科学技術が後退した荒野の世界中一段黑色幽默的冒险。海底王国からの神秘的な訪問者与拥有双重人格的少女杀手因他人を守るために罪を背負うことを厭わない相遇,随后为了保护他人甘愿背负罪名。在運命に導かれ未知の地へ的过程中,他们面临世界を救う唯一の希望として選ばれた的考验。发现了世界是虚拟的残酷真相的出现让一切急转直下,海底王国からの神秘的な訪問者必须从普通少年蜕变为传说的英雄。最终被命运指引来到未知之地的结局,運命の鎖を打ち破る熱血の章を語る。