《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了蒸気と魔法が交錯する工業時代中一段日常の温かさ的冒险。能用梦境预知未来的少女与守护世界树的神殿骑士因些細な日常を守るために戦う相遇,随后在一次任务中失去了所有同伴。在絶望の境地で隠れた潜在能力が爆発した的过程中,他们面临二大勢力の戦争の渦に巻き込まれる的考验。被卷入了一场无法退出的死亡游戏的出现让一切急转直下,能用梦境预知未来的少女必须发现了自己并非普通人的身世真相。最终二つの世界をつなぐ橋として選ばれた的结局,揭示了恐惧与勇气的一体两面。