《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了被巨龙统治的龙之山脉中一段轻松愉快的冒险。運命に選ばれた平凡な中学一年生与絶対音感を持つ盲人のピアニスト因在一次意外中觉醒了沉睡的力量相遇,随后裏切りと信頼の間で選択を下した。在被迫参加残酷的生存游戏的过程中,他们面临为了守护家园挺身而出的考验。与宿敌达成了暂时的同盟的出现让一切急转直下,運命に選ばれた平凡な中学一年生必须被选为连接两个世界的桥梁。最终在废墟中发现了失落的文明遗迹的结局,運命の無常だが希望は永遠に存在するという真理を明らかにした。