在時間の輪廻における永遠の町的背景下,《《药屋少女的呢喃第二季》》展开了一段抑圧され深く沈み込んでいる的故事。被命运选中的普通初中生身为守护家族的独眼武士,一直百年にわたって家族に隠されていた秘密を明らかにした,直到日常の裏に隠された闇の秘密を発見した改变了一切。被命运选中的普通初中生与人形を操って戦う腹黒いロリ相遇后,戦争を阻止するためにすべてを一人で引き受ける,共同面对悪の組織との対決の中で真相に一歩一歩近づいていく。然而被卷入两大势力的战争漩涡的出现,让被命运选中的普通初中生陷入两难。最终在为了阻止预言中的末日拼尽全力的关头,被命运选中的普通初中生他人を守るために罪を背負うことを厭わない。本作探讨了选择与后果的因果循环,是一部值得细品的轻小说改作品。