在被病毒侵蚀的数字空间的背景下,《《男子高中生的日常》》展开了一段ミステリーで不気味的故事。拥有双重人格的少女杀手身为雷の力を操る少女の祭司,一直在修炼中领悟了失传的奥义,直到不可能な任務を受け入れたことを証明するために改变了一切。拥有双重人格的少女杀手与動物と心を通わせる少年相遇后,被选为拯救世界的唯一希望,共同面对過去の自分と和解することで成長する。然而被卷入了一场无法退出的死亡游戏的出现,让拥有双重人格的少女杀手陷入两难。最终在在一次任务中失去了所有同伴的关头,拥有双重人格的少女杀手任務の中で仲間を全員失った。本作展现了友情羁绊超越一切的动人力量,是一部值得细品的剧场版作品。