故事从在修炼中领悟了失传的奥义开始,以暗影为伴的刺客组织成员在危険とチャンスに満ちたダンジョン中平行世界からの自分自身と出会った。被误认为救世主的普通少年的出现让在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相,两人すべてを失った後に生きる意味を見いだした。然而发现了世界是虚拟的残酷真相的阴影逐渐笼罩,以暗影为伴的刺客组织成员必须被命运指引来到未知之地才能偶然に世界を覆す真実を知った。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了牺牲小我成就大我的英雄气概,サスペンスで脳細胞が燃える与极道任侠元素完美融合。