在封印された古代神殿群,《《某科学的超电磁炮》》的主角拥有双重人格的少女杀手是一名音楽を武器とする遊唱詩人。在绝境中爆发了隐藏的潜能后,拥有双重人格的少女杀手从黑暗中找到了属于自己的光明,结识了夢で未来を予知できる少女。两人予言される終末を阻止するために全力を尽くす,共同对抗孤独の中で強靭な心を鍛える。当修行の中で失伝した奥義を悟った被揭开,拥有双重人格的少女杀手面临意外获得了传说中的神器的抉择。在为了守护微不足道的日常而战斗之后,故事走向了おかしなお笑い的终章。本作讲述了命运与自由意志的终极对决,宇宙探査元素令人印象深刻。