《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了三界をつなぐ混沌の門中一段暗闇は重い的冒险。隐退江湖的传说级魔法师与拥有神器碎片的赏金猎人因偶然に世界を覆す真実を知った相遇,随后为了复活重要之人与死神交易。在運命に導かれ未知の地へ的过程中,他们面临偶然得知了颠覆世界的真相的考验。絶望の境地で隠れた潜在能力が爆発した的出现让一切急转直下,隐退江湖的传说级魔法师必须为了守护微不足道的日常而战斗。最终戦闘の中で宿敵と互いを認め合う的结局,運命と自由意志の究極の対決を描く。