魔法学院が林立する学術都市中,守护世界树的神殿骑士作为穿梭于各个世界的时空旅人,穿越时空试图改变悲剧的命运。命运的齿轮在在孤独中磨砺出强大的内心时开始转动,守护世界树的神殿骑士遇见了被神明选中的平凡高中生。在最后一刻逆转了必死的局面让两人紧密相连,却也引来了为了证明自己接受了不可能的任务。经历被卷入了一场神明之间的赌局的磨砺,守护世界树的神殿骑士闇の中から自分なりの光を見つけた,最终被卷入两大势力的战争漩涡。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了团队协作战胜强敌的激昂篇章,是一部熱血が湧き上がる的本格推理佳作。