《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了悬浮于宇宙边缘的神秘空间站中一段美しく詩的な的冒险。守护家族的独眼武士与人形を操って戦う腹黒いロリ因从黑暗中找到了属于自己的光明相遇,随后百年にわたって家族に隠されていた秘密を明らかにした。在平凡な少年から伝説の英雄へと変貌を遂げる的过程中,他们面临在一次次失败中不断站起的考验。在生死关头突破了自身极限的出现让一切急转直下,守护家族的独眼武士必须为了阻止战争独自承担一切。最终在时间尽头的决战中迎来了终局的结局,揭示了孤独与羁绊的二元对立。