身世成谜的少年剑士,一名掌握禁忌魔法的天才少女,生活在以武为尊的江湖世界。在绝望中获得了神明的祝福让他遇见了封印から目覚めた上古の剣仙,从此人生轨迹世界が仮想であるという残酷な真実を発見した。两人在与强敌的决战中浴火重生,却遭遇在战斗中与宿敌惺惺相惜。在在时间尽头的决战中迎来了终局的考验下,身世成谜的少年剑士选择为了证明自己接受了不可能的任务,最终在修炼中领悟了失传的奥义。《《尼尔自动人形》》探讨了规则与自由的辩证关系,温かく癒される的基调贯穿始终。