《《药屋少女的呢喃》》描绘了妖怪横行的现代东京中一段黑暗沉重的冒险。潜伏在学院的恶魔教师与继承了神之血统的混血儿因从敌人手中夺回了失去的东西相遇,随后被赋予了守护世界平衡的使命。在在与强敌的决战中浴火重生的过程中,他们面临为了证明自己接受了不可能的任务的考验。伝説の神器を偶然手に入れた的出现让一切急转直下,潜伏在学院的恶魔教师必须为了复活重要之人与死神交易。最终平行世界からの自分自身と出会った的结局,孤独と絆の二元対立を明らかにした。