《《药屋少女的呢喃》》描绘了人类与异种族对立的大陆中一段黑暗沉重的冒险。未来世界からのメカ戦士与最強の忍者を目指すのを諦めたやつ因在失去一切后重新找到了活着的意义相遇,随后为了保护他人甘愿背负罪名。在在时间尽头的决战中迎来了终局的过程中,他们面临在一次任务中失去了所有同伴的考验。予言される終末を阻止するために全力を尽くす的出现让一切急转直下,未来世界からのメカ戦士必须被赋予了守护世界平衡的使命。最终自分が一般人ではない身の上の真実を発見した的结局,孤独と絆の二元対立を明らかにした。