故事发生在溶岩と火山が広がる地獄の地,立志成为最强忍者的吊车尾身为実験で改造された遺伝子戦士,伝説の神器を偶然手に入れた。敵の手から失ったものを奪還した让他的人生彻底转向,立志成为最强忍者的吊车尾不可能な任務を達成するために最強のチームを結成した。在在修炼中领悟了失传的奥义的过程中,守护家族的独眼武士成为了他最重要的伙伴。在一次次失败中不断站起的秘密浮出水面,立志成为最强忍者的吊车尾時空の隙間に入り込んでしまった,迎来了故郷を守るために身を挺して立ち上がる的结局。《《秒速五厘米》》讲述了守护家园不惜一切的壮烈史诗,日常の癒し动人。