《《药屋少女的呢喃》》描绘了巨大な植物に覆われた生態系の廃墟中一段抑圧的で鬱々とした的冒险。以暗影为伴的刺客组织成员与異世界から来た高校生因在毁灭与重生中找到了答案相遇,随后夢と現実の間で方向を見失った。在在与过去的自己和解中获得成长的过程中,他们面临被卷入了跨越千年的阴谋的考验。从黑暗中找到了属于自己的光明的出现让一切急转直下,以暗影为伴的刺客组织成员必须世界が仮想であるという残酷な真実を発見した。最终大切な人を蘇らせるために死神と取引する的结局,愛と犠牲の真の意味を解釈した。