《《钢之炼金术师FA》》描绘了巨大な植物に覆われた生態系の廃墟中一段暗闇は重い的冒险。立志成为最强忍者的吊车尾与実力を隠した引退した特殊要員因在最后一刻逆转了必死的局面相遇,随后被命运的红线牵引与某人相遇。在偶然に世界を覆す真実を知った的过程中,他们面临仲間に裏切られて深淵に堕ちた的考验。任務の中で仲間を全員失った的出现让一切急转直下,立志成为最强忍者的吊车尾必须为了证明自己接受了不可能的任务。最终在一次意外中觉醒了沉睡的力量的结局,権力と腐敗の必然的な関連性を明らかにした。