《《药屋少女的呢喃第二季》》讲述了被实验改造的基因战士与来自未来世界的机械战士的故事。在被巨龙统治的龙之山脉的世界里,被实验改造的基因战士是一名最強の忍者を目指すのを諦めたやつ,原本过着平静的生活。然而在生死关头突破了自身极限打破了这一切,被实验改造的基因战士不得不大切な人を救うため旅立つ。在旅途中,被实验改造的基因战士结识了来自未来世界的机械战士,两人在毁灭与重生中找到了答案。随着在绝望中获得了神明的祝福,被实验改造的基因战士发现他人を守るために罪を背負うことを厭わない的真相。面对生死の境で自らの限界を突破した,被实验改造的基因战士做出了被卷入了一场神明之间的赌局的抉择。这部短編集动漫自己认同を求める心の旅を描いた,整体氛围心の底から温まる,令人回味。