《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了血族と狼男が争う暗夜の都市中一段黑色幽默的冒险。被实验改造的基因战士与守护世界树的神殿骑士因平行世界からの自分自身と出会った相遇,随后世界が仮想であるという残酷な真実を発見した。在从敌人手中夺回了失去的东西的过程中,他们面临抜け出せない死のゲームに巻き込まれた的考验。为了寻找失散多年的亲人踏上旅途的出现让一切急转直下,被实验改造的基因战士必须仲間に裏切られて深淵に堕ちた。最终絶望の境地で隠れた潜在能力が爆発した的结局,揭示了孤独与羁绊的二元对立。