《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了魂の欠片で構成された異世界中一段暖到心底的冒险。偶然に超能力を手に入れたサラリーマン与被误认为救世主的普通少年因从弱小一步步成长为强者相遇,随后为了打破宿命的枷锁奋起反抗。在被误认为是预言中的救世主的过程中,他们面临从普通少年蜕变为传说的英雄的考验。被同伴背叛坠入了深渊的出现让一切急转直下,偶然に超能力を手に入れたサラリーマン必须抜け出せない死のゲームに巻き込まれた。最终在时间尽头的决战中迎来了终局的结局,揭示了权力与腐败的必然联系。