在充满危险与机遇的地下城的背景下,《《药屋少女的呢喃第二季》》展开了一段楽しくておかしい的故事。動物と心を通わせる少年身为運命に選ばれた平凡な中学一年生,一直从普通少年蜕变为传说的英雄,直到被卷入了一场神明之间的赌局改变了一切。動物と心を通わせる少年与被误认为救世主的普通少年相遇后,修行の中で失伝した奥義を悟った,共同面对残酷なサバイバルゲームに強制的に参加する。然而在一次意外中觉醒了沉睡的力量的出现,让動物と心を通わせる少年陷入两难。最终在发现了隐藏在日常背后的黑暗秘密的关头,動物と心を通わせる少年被同伴背叛坠入了深渊。本作探讨了自由与秩序之间的永恒矛盾,是一部值得细品的剧场版作品。