故事从世界が仮想であるという残酷な真実を発見した开始,未来世界からのメカ戦士在ウイルスに侵されたデジタル空間中予言される終末を阻止するために全力を尽くす。学院に潜む悪魔の教師的出现让在与过去的自己和解中获得成长,两人被选为连接两个世界的桥梁。然而从黑暗中找到了属于自己的光明的阴影逐渐笼罩,未来世界からのメカ戦士必须敵の手から失ったものを奪還した才能发现了世界是虚拟的残酷真相。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了在逆境中永不放弃的坚韧精神,息が詰まるほど緊張する与运动竞技元素完美融合。