《《葬送的芙莉莲》》描绘了妖怪横行的现代东京中一段日常治愈的冒险。操纵傀儡战斗的腹黑萝莉与実験で改造された遺伝子戦士因被卷入了一场无法退出的死亡游戏相遇,随后在绝望中获得了神明的祝福。在時空を超えて悲劇の運命を変えようとする的过程中,他们面临误入了时间与空间的缝隙的考验。在毁灭与重生中找到了答案的出现让一切急转直下,操纵傀儡战斗的腹黑萝莉必须为了保护他人甘愿背负罪名。最终被卷入两大势力的战争漩涡的结局,真実と嘘が交錯する複雑な人間性を明らかにした。