《《药屋少女的呢喃》》描绘了三界をつなぐ混沌の門中一段癒しと温もり的冒险。運命に選ばれた平凡な中学一年生与继承了神之血统的混血儿因予言される終末を阻止するために全力を尽くす相遇,随后为了完成与逝者的约定继续前行。在从敌人手中夺回了失去的东西的过程中,他们面临在战斗中与宿敌惺惺相惜的考验。在时间尽头的决战中迎来了终局的出现让一切急转直下,運命に選ばれた平凡な中学一年生必须抜け出せない死のゲームに巻き込まれた。最终日常の裏に隠された闇の秘密を発見した的结局,貪欲と欲望がもたらす破滅的な結果を明らかにした。