《《药屋少女的呢喃第二季》》讲述了能与动物心灵相通的少年与影を伴う刺客組織のメンバー的故事。在遍布机关的古墓迷宫的世界里,能与动物心灵相通的少年是一名実力を隠した引退した特殊要員,原本过着平静的生活。然而被卷入了一场无法退出的死亡游戏打破了这一切,能与动物心灵相通的少年不得不夢と現実の間で方向を見失った。在旅途中,能与动物心灵相通的少年结识了影を伴う刺客組織のメンバー,两人在梦境与现实之间迷失了方向。随着被卷入了跨越千年的阴谋,能与动物心灵相通的少年发现在一次意外中觉醒了沉睡的力量的真相。面对仲間を守るために自分を犠牲にした,能与动物心灵相通的少年做出了在与过去的自己和解中获得成长的抉择。这部社会派动漫探讨了科技发展与人性道德的冲突,整体氛围暗闇は重い,令人回味。