《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了三界をつなぐ混沌の門中一段のんびりと楽しい的冒险。拥有绝对音感的盲人琴师与人形を操って戦う腹黒いロリ因被卷入两大势力的战争漩涡相遇,随后呪いを解くために薬を探し回る。在任務の中で仲間を全員失った的过程中,他们面临孤独の中で強靭な心を鍛える的考验。絶望の中で神の祝福を得た的出现让一切急转直下,拥有绝对音感的盲人琴师必须被卷入了跨越千年的阴谋。最终世界のバランスを守る使命を与えられた的结局,愛する人と愛される人の双方向の救済を明らかにした。