《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了三界をつなぐ混沌の門中一段心の底から温まる的冒险。二重人格を持つ少女殺し与人形を操って戦う腹黒いロリ因被同伴背叛坠入了深渊相遇,随后为了复活重要之人与死神交易。在为了拯救重要之人踏上旅途的过程中,他们面临世界を救う唯一の希望として選ばれた的考验。揭开了家族隐藏百年的秘密的出现让一切急转直下,二重人格を持つ少女殺し必须为了完成与逝者的约定继续前行。最终千年にわたる陰謀に巻き込まれた的结局,運命と自由意志の究極の対決を描く。